有很多专家认为，船上的人因为某个原因觉得船上的酒精将要爆炸，因此弃船逃命，但船上的酒精并没有爆炸，玛丽·西莱斯特号继续航行，船上的人下船后由于缺少食物以及淡水，在距离岸边几百英里的地方就死了。
让船员和船长弃船的某个原因又是什么呢?既没有海盗袭击又没有遭遇风暴，玛丽·西莱斯特号究竟藏着怎样的秘密。面对这种无解之谜，人们不得不幻想船员们是否被外星人绑架或者遭遇了大海怪的袭击，要不怎么会无缘无故人间蒸发呢?
但所有合理的解释，包括海盗袭击或者遭遇风暴等都被一一排除。最后人们不得不幻想着船员们是不是“被外星人绑架了”，或者“遭遇了大海怪的袭击”。直到今天，玛丽·西莱斯特号究竟遭遇了什么仍然是航海史上最着名的谜案。
